干不满三个月扣工资是不合法的。
法律并未规定劳动者需要干满三个月才能离职，劳动者提前一个月书面告知用人单位即可解除劳动合同关系，试用期提前三天告知即可。
劳动关系解除后用人单位应当结清劳动者工资，不得随意克扣。
若用人单位存在克扣劳动者工资的行为，劳动者可以向用人单位所在地劳动保障监察部门投诉或依法申请劳动仲裁。
试用期：劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。
用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分，逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
(一)未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬;
(二)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
(三)安排加班不支付加班费的；
(四)解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。
法律依据：
《中华人民共和国劳动法》
第三十七条
劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
第三十
用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：
(一)未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的；
(二)未及时足额支付劳动报酬的；
(三)未依法为劳动者缴纳社会保险费的；
(四)用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；
(五)因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的；
(六)法律、行规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。